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Qiagen為您帶來ccfDNA一體化處理方案

更新時(shí)間:2022-03-04瀏覽:1850次

什么是ccfDNA?

    循環(huán)無細(xì)胞 DNA (ccFDNA) 分子于 1948 年被發(fā)現(xiàn)。隨后的研究表明,與健康個(gè)體相比,自身免疫性疾病和癌癥患者中 CCFDNA 的含量更高。

   在健康個(gè)體中,循環(huán) DNA 的濃度很低,因?yàn)榇蠖鄶?shù)非活細(xì)胞被吞噬細(xì)胞有效地從循環(huán)中去除。鑒定 DNA 的方法主要是關(guān)注的主要來源細(xì)胞凋亡被證實(shí)是血漿或血清中 DNA 的主要來源之一。其他次要來源包括通過壞死途徑進(jìn)行的細(xì)胞裂解、新合成核酸的自發(fā)釋放、血細(xì)胞的分解、細(xì)菌或病毒等任何病原體的分解以及白細(xì)胞表面 DNA。ccfDNA的存在也在其他來源中進(jìn)行評估,包括尿液、滑液、唾液和痰液,用于癌癥診斷。由于血清/血漿中發(fā)現(xiàn)的抑制/消化因子,尿液可能是比血漿或血清更好的 ccfDNA 來源。

    循環(huán)游離 DNA (ccfDNA) 的定性和定量檢測可用于惡性和良性腫瘤的管理。檢測癌癥患者的循環(huán) DNA 可能有助于開發(fā)用于惡性腫瘤早期診斷的 DNA 譜。今天給大家介紹Qiagen從血液中獲取、使用和分析 ccfDNA的一體化分析方案。

 

Qiagen一體化處理方案:

采集和穩(wěn)定

Qiagen 768115  PAXgene Blood ccfDNA采血管

用于采集全血樣本和穩(wěn)定 ccfDNA,采用了一種非交聯(lián)反應(yīng)的穩(wěn)定劑,可有效防止溶血及gDNA的釋放,最大限度減少對ccfDNA的改變。

產(chǎn)品特點(diǎn):

單管收集、穩(wěn)定、運(yùn)輸和儲(chǔ)存 

立即穩(wěn)定循環(huán)的游離 DNA (ccfDNA) 

樣品在室溫下運(yùn)輸和儲(chǔ)存長達(dá) 10 天 

標(biāo)準(zhǔn)化樣品的分析前處理

 

ccfDNA的分離:

Qiagen 55114 QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit

從人類血漿或血清中濃縮和純化游離DNA和RNA,無需酚氯仿,核酸與QIAamp Mini柱特異結(jié)合,通過3步洗滌可*去除PCR抑制劑,只留下純凈的核酸。

產(chǎn)品特點(diǎn):

濃縮的核酸,高上樣量,低洗脫體積

高效回收DNA和RNA碎片

無需有機(jī)提取或乙醇沉淀

*去除污染物和抑制劑

 

ccfDNA測序

Qiagen 180023 QIAseq cfDNA All-in-One Kits(illumina)

用于將任何液體活檢樣本的ccfDNA從血漿轉(zhuǎn)換為NGS文庫,讓文庫制備更加方便和高效,以滿足外顯子組或全基因組測序的需求。

特征 

通過高效的連接化學(xué),在從血漿到 NGS 文庫的每一步實(shí)現(xiàn) cfDNA 的最佳轉(zhuǎn)化 

使用支持廣泛 cfDNA 輸入范圍 (1–100ng) ,無需定量即可直接從洗脫液進(jìn)入文庫制備

從 10 ng cfDNA 生成無 PCR 文庫

通過使用高保真擴(kuò)增試劑最大限度地減少 PCR 偏差

使用預(yù)分配板式適配器降低交叉污染風(fēng)險(xiǎn),最多可運(yùn)行 96 個(gè)樣品/NGS


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